免疫共沉淀Co-IP是研究蛋白間相互作用的經(jīng)典方法,其以抗體和抗原間的專一性作用為基礎(chǔ),通過偶聯(lián)beads的Protein A/G與A蛋白及抗體復(fù)合物結(jié)合,進(jìn)而將潛在的與A蛋白互作的B蛋白也沉淀下來(lái)。一般后續(xù)再對(duì)拿到的免疫復(fù)合物進(jìn)行WB分析驗(yàn)證。
免疫共沉淀Co-IP本身的操作流程并不復(fù)雜,麻煩的是相關(guān)的操作步驟需要根據(jù)實(shí)驗(yàn)實(shí)際情況進(jìn)行優(yōu)化。辛辛苦苦忙活了好一陣子,你拿到的Co-IP結(jié)果很可能是這樣的。
免疫共沉淀Co-IP的高背景和抗體污染(IgG交叉反應(yīng))問題相當(dāng)令人頭疼,以下是小愛整理給到您的優(yōu)化建議:
1)針對(duì)非特異性作用的高背景
細(xì)胞裂解物中存在大量蛋白質(zhì),可能會(huì)在操作過程中發(fā)生與目標(biāo)復(fù)合物的非特異性結(jié)合。這些非特異性相互作用一般通過*清洗beads結(jié)合的免疫復(fù)合物來(lái)清除,但也可以應(yīng)用其他策略來(lái)優(yōu)化非特異性結(jié)合,例如:
▲ 通過將鹽濃度從120mM滴定至1000mM來(lái)改變緩沖液的離子強(qiáng)度;
▲ 減少一抗的使用量,直到信號(hào)干擾比;
▲ 參考我們推薦的操作步驟,進(jìn)行細(xì)胞裂解物預(yù)清除。
2)針對(duì)抗體污染(IgG交叉反應(yīng))
免疫共沉淀Co-IP抗體污染問題是在WB分析中來(lái)自IP抗體IgG條帶的干擾(IP抗體與WB抗體同源時(shí)發(fā)生),IgG的輕重鏈在25kD和50kD左右,并且在SDS-PAGE中可能會(huì)有<5kD的偏移。針對(duì)這種情況可以采用以下幾種方法進(jìn)行優(yōu)化:
▲ IP和WB采用不同來(lái)源抗體,IP為鼠源則WB可以選用兔抗;
▲ 采用特異性識(shí)別IgG輕鏈或者重鏈的二抗,如目的蛋白與IgG輕鏈接近、則可采用重鏈二抗;
▲ 運(yùn)用交聯(lián)劑將IP抗體和Protein A/G -Beads交聯(lián),通過添加不含巰基乙醇的加樣緩沖液處理目的蛋白-抗體- Protein A/G-beads復(fù)合物,后離心去除復(fù)合物,上清中只留下目的蛋白;
▲ WB分析前,可以考慮采用低pH洗脫來(lái)代替煮沸,低pH值(2-3)可以降低抗原/抗體相互作用、從而將抗原和抗體分離(如1M甘氨酸緩沖液,pH 2-3),注意電泳前需平衡pH;
▲ 將常用的融合標(biāo)簽(如GFP)摻入用于Co-IP主要靶蛋白中,選用優(yōu)質(zhì)特異性的抗融合標(biāo)簽抗體,有需要時(shí)還可將該抗體預(yù)固定以用于蛋白復(fù)合物純化。
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abs20035 | Rabbit IgG | 10mg | 380 |
abs20038 | Mouse IgG | 1mg | 250 |
abs926 | WB solution base kit(rabbit) | 1kit | 735 |
abs927 | WB solution base kit(mouse) | 1kit | 735 |
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